連續(xù)監(jiān)測法主要采用連續(xù)排放監(jiān)測系統(tǒng)（CEMS），通過直接測量煙氣流速和煙氣中二氧化碳濃度來計算溫室氣體的排放量。與核算法相比，連續(xù)監(jiān)測法具有連續(xù)性強、自動化處理的優(yōu)勢。美國環(huán)保署（EPA）頒布的《溫室氣體強制性報告》要求，已經(jīng)擁有在線監(jiān)測設(shè)備的企業(yè)必須監(jiān)測二氧化碳濃度計算排放量，且監(jiān)測頻次要達到逐小時級。企業(yè)安裝監(jiān)測設(shè)備后需上報EPA，得到認證后方可開始監(jiān)測。根據(jù)EPA的統(tǒng)計，2015年美國73.9%的火電機組應(yīng)用連續(xù)監(jiān)測方法進行碳排放監(jiān)測。

歐盟碳交易體系規(guī)定，連續(xù)監(jiān)測方法與核算方法的監(jiān)測結(jié)果具有等效性。歐盟通過規(guī)定各類數(shù)據(jù)應(yīng)滿足的數(shù)據(jù)層級要求，確保兩種方法具有可比的數(shù)據(jù)質(zhì)量。但是歐盟使用連續(xù)監(jiān)測方法的案例較少，2019年只有155個設(shè)施（占總設(shè)施數(shù)的1.5%）。主要原因在于需要安裝價格不菲的監(jiān)測設(shè)施，煙氣中相關(guān)溫室氣體的濃度測量和檢測儀器維護等工作具有較高的專業(yè)性，而這些都是中小型排放企業(yè)難以實現(xiàn)的。

2012年，我國出現(xiàn)第一家采用CEMS監(jiān)測溫室氣體排放量的電廠。到目前為止，只有少數(shù)發(fā)電企業(yè)在煙氣管道上安裝了CEMS，來直接監(jiān)測溫室氣體排放。今年3月，我國啟動了發(fā)電行業(yè)碳排放在線監(jiān)測試點工作。總體來看，制約我國采用連續(xù)監(jiān)測法監(jiān)測二氧化碳排放的首要因素是經(jīng)濟因素。除此之外，CEMS監(jiān)測二氧化碳對電力、鋼鐵、水泥等不同行業(yè)的適用性，以及CEMS監(jiān)測結(jié)果與基于核算法的數(shù)據(jù)結(jié)果的可比性也是重要的考慮因素。